Operaciones exentas de IVA en contabilidad

No todas las operaciones sin IVA son iguales: el tipo de exención decide si puedes recuperar el IVA que pagas a tus proveedores.

Una factura sin IVA puede responder a situaciones muy distintas: una operación no sujeta (fuera del impuesto, como la venta de un negocio completo), una operación exenta (dentro del impuesto, pero liberada de pagarlo por ley) o una operación con inversión del sujeto pasivo (el impuesto existe, pero lo declara el cliente). Para contabilizar bien una exención hay que saber primero de qué clase es, porque de eso depende lo que pasa con el IVA de las compras.

Exenciones limitadas y exenciones plenas

Tipo Ejemplos ¿Se deduce el IVA soportado?
Limitadas (art. 20 LIVA) asistencia sanitaria de médicos y otros profesionales sanitarios, servicios de dentistas, educación de la infancia y la juventud, clases particulares de materias del sistema educativo, seguros, operaciones financieras, alquiler de vivienda, segundas entregas de edificaciones, terrenos rústicos No, en la parte vinculada a esas operaciones
Plenas exportaciones (art. 21), entregas intracomunitarias de bienes (art. 25), servicios relacionados con importaciones (art. 64) Sí, como si la venta estuviera gravada

La diferencia es económica. En una exención plena el IVA desaparece de toda la cadena y el exportador recupera lo que pagó a sus proveedores. En una exención limitada el cliente no paga IVA, pero el prestador no puede deducir el IVA de sus compras (art. 94 LIVA), que pasa a ser un coste más. Por eso un consultorio médico o una aseguradora trabajan con costes más altos que una empresa de su tamaño con actividad gravada.

Cada exención del artículo 20 tiene requisitos propios. La educación exige que se trate de enseñanzas del sistema educativo o de centros autorizados, y la asistencia sanitaria, que tenga una finalidad diagnóstica o terapéutica. Un tratamiento estético o un curso de ocio pueden no estar exentos aunque los preste el mismo centro.

¿Hay que emitir factura por una operación exenta?

El Reglamento de facturación (RD 1619/2012) parte de que se factura todo, incluidas las operaciones exentas (art. 2.1). Su artículo 3.1.a) libera de esa obligación a la mayoría de las exenciones del artículo 20, con dos salvedades:

Seguros y operaciones financieras tienen su propio régimen en el artículo 3.2.

Cuando se factura, la factura debe indicar que la operación está exenta y, preferiblemente, el precepto que lo ampara (art. 6.1.j), por ejemplo: «Operación exenta de IVA en virtud del artículo 20.Uno.3.º de la Ley 37/1992». El resto de menciones obligatorias son las de cualquier factura, que puedes repasar en datos obligatorios de una factura.

Cómo se registra una actividad solo exenta

Una clínica de fisioterapia, con todos sus servicios exentos por asistencia sanitaria, tiene en un mes estos movimientos:

Como no puede deducir nada, el IVA soportado se suma al coste. En el inmovilizado, el PGC solo excluye del precio de adquisición los impuestos indirectos recuperables de la Hacienda Pública; el que no se recupera forma parte del valor del activo y se amortiza con él.

Cuenta Debe Haber
570 Caja / 572 Bancos (cobro de sesiones) 6.000,00
705 Prestaciones de servicios 6.000,00
216 Mobiliario (camilla, IVA incluido) 3.025,00
628 Suministros (luz, IVA incluido) 363,00
523 Proveedores de inmovilizado 3.025,00
410 Acreedores por prestaciones de servicios 363,00

No aparecen las cuentas 472 ni 477. La clínica tampoco presenta el modelo 303 si todas sus operaciones son exentas sin derecho a deducción, aunque sí debe declarar en el modelo 347 sus operaciones con terceros que superen el umbral anual, porque el 347 incluye las operaciones exentas.

Actividades mixtas: aquí entra la prorrata

Si la misma clínica empieza a vender productos de ortopedia o cremas con IVA, ya realiza operaciones con y sin derecho a deducción. Desde ese momento debe presentar el 303 por esas ventas y aplicar la regla de prorrata al IVA de los gastos comunes. El cálculo se explica en prorrata de IVA en pymes. Si compra bienes de inversión con la actividad ya mixta, quedará además sujeta a la regularización de esos bienes durante varios años.

La guía contable para clínicas privadas y la de academias tratan los casos frontera de cada sector.

Renunciar a la exención en operaciones inmobiliarias

Las segundas y ulteriores entregas de edificaciones y las entregas de terrenos rústicos están exentas, pero el artículo 20.Dos permite renunciar a la exención cuando el comprador es un empresario con derecho a deducir, total o parcialmente, el IVA de la compra. Con la renuncia, la operación tributa por IVA en vez de por la modalidad de transmisiones patrimoniales del ITP, el comprador se convierte en sujeto pasivo por inversión y puede deducir esa cuota. Para el vendedor, además, evita la regularización desfavorable del IVA que dedujo al adquirir el inmueble. Es una decisión que debe tomarse antes de escriturar. Más detalle sectorial en contabilidad para inmobiliarias.

Fallos frecuentes con las exenciones

Configurar en el programa de contabilidad un código de IVA distinto para cada clase de exención (limitada, plena, no sujeta) evita que todas acaben mezcladas bajo un mismo «0 %».

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